بدء فى انشاء اول خط حديدى فى مصر يوم 12 يولية عام 1851, و بدأ التشغيل ابان الاحتفالات بافتتاح قناة السويس عام 1854 فى عهد الخديوى اسماعيل باشا و مما يذكر ان المشرف على مشروع بناء السكك الحديدية المصرية اّنذاك كان المهندس الانجليزى روبرت ستيفنسون و هو ابن مخترع القاطرة الشهير جورج ستيفنسون.
يبلغ طول الشبكة الحديدية حوالى 6700 كم منها حوالى 4872 كم تشكل مجموع اطوال الخطوط الطولى, و يبلغ عدد المخطات و المواقف ( الهلتات) و نقط البلوك على الشبكة اكثر من 820 محطة, منها عشرون محطة رئيسية فى عواصم المحافظات فى الدلتا و القناة و الوجة القبلى, و بذلك تربط شبكة السكك الحديدية الوادى من اقصاة الى ادناة على على طول اكثر من 1000 كيلو متر
توفر الهيئة لجمهورها خدمة النقل بشقيها : نقل الاشخاص و نقل البضائع , و لتحقيق ذلك و لتلبية كل الاحتياجات , فان الهيئة تقوم فيما يخص خدمة نقل الركاب بتسيير قطارات سريعة فاخرة بالدرجتين الاولى و الثانية مكيفة الهواء ( حمبع الخطوط) , و قطارات توربينية فاحرة ( خط القاهرة - الاسكندرية) , و قطارات نوم فاخرة ( طوال العام للوجة القبلى و صيفية من القاهرة الى مرسى مطروح) .
و تيسر هيئة قطارات الاكسبريس السريعة بالدرجات بالدرجات العادية و المختلطة , هذا الى جانب قطارات خطوط و مناطق الضواحى بالدرجة الموحدة ( خط ابو قير و خط المرج - شبين القناطر ) , ايضا تقوم الهيئة بتنفيذ و تشغيل خطوط مترو الانفاق بالقاهرة الكبرى و تم تشغيل الخط الاقليمى المرج- حلوان فى بداية 1989 و تم تشغيل الخط الثانى شبرا الخيمة - ضواحى الجيزة.
و فيما يختص بنقل البضائع توفر الهيئة نوعين من الخدمة: خدمة نقل البضائع بالمستعجل على قطارات الركاب نفسها لبعض انواع السلع ( العفش , الطرود , وسائل النقل الخفيف , الاطعمة ... ) . و خدمة النقل لغير المستعجل على قطارات نقل البضائع